RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC01559Q495D7 138 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 VSTM5A8MXK1 200 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 FAM27E3Q08E93 113 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRR-201ENST00000283228 TEX22C9J3V5 150 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 Q8N1Y9 231 aa8.82□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 A4D1N5 150 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 FOXC1Q12948 553 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 BAALCQ8WXS3 180 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 ADIPOQQ15848 244 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 ASIPP42127 132 aa8.79□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 GATA4P43694 442 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 NRACQ8N912 160 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 H3BMM0 161 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 M0QXV9 152 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 DUX3Q96PT4 197 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.78□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 A0A0J9YY99 117 aa8.77□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 C17orf100A8MU93 164 aa8.77□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 CD7P09564 240 aa8.77□□□□□ -1
PTPRR-201ENST00000283228 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.77□□□□□ -1
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PTPRR-201ENST00000283228 Q6ZS92 163 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRR-201ENST00000283228 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.77□□□□□ -1.01
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