RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.75□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.75□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A0D9SG52 128 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE12BA1L429 117 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 K7EQM0 130 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE7O76087 117 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE12FP0CL80 117 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE12GP0CL81 117 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE12IP0CL82 117 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SSX7Q7RTT5 188 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.74□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 LYSTQ99698 3801 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 LCE2BO14633 110 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCRAP04437 139 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF726P1Q15940 193 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZQT7 251 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TREM1Q9NP99 234 aa8.73□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1W2PRE2 83 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCL1AP56279 114 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR5I1Q13606 314 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MUC21Q5SSG8 566 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6AWC8 147 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZTI0 123 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SGK494Q96LW2 274 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 EPDR1Q9UM22 224 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.72□□□□□ -1.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 GGTLC3B5MD39 225 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCL2L11O43521 198 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PFDN1O60925 122 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFNA7P01567 189 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF415Q09FC8 603 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 STOML3Q8TAV4 291 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 NAGKQ9UJ70 344 aa8.71□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 F6UZH7 168 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUDT3O95989 172 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEC11BP0C7V7 166 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2G2P60604 165 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TVP23CQ96ET8 276 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATG101Q9BSB4 218 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSG8Q9UQ74 426 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 UMAD1C9J7I0 102 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPINK4O60575 86 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF212Q495C1 297 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMUB2Q71RG4 321 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRNTQ86SH4 94 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 C18orf15Q96N68 181 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM74A7A6NL05 159 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOXA5P20719 270 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FHITP49789 147 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPT1P50897 306 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TDRG1Q3Y452 100 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZFP69Q49AA0 526 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZNX1 250 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPXQ9BT56 116 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MDFICQ9P1T7 246 aa8.68□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A0J9YY99 117 aa8.67□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PEX7O00628 323 aa8.67□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNRH2O43555 120 aa8.67□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGLV2-11P01706 119 aa8.67□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMUG1Q53HV7 270 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms