RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 IGHV3-13P01766 116 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 GUSBP11Q6P575 273 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 LILRA5A6NI73 299 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 WISP1O95388 367 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 CLPSP04118 112 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 DCANP1Q8TF63 244 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 DEFB118Q96PH6 123 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.5□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 PRSS38A1L453 326 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 C10orf128Q5T292 105 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 COX6CP09669 75 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 ZNF134P52741 427 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 CFHR3Q02985 330 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.49□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 A0A0C4DFX4 3053 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TMEM223A0PJW6 202 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 LST1O00453 97 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 IGHG2P01859 326 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 Q6JHZ5 121 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.48□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 A0A1W2PP55 124 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TEX22C9J3V5 150 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 USP17L23D6RBM5 183 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TRIAP1O43715 76 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 COX7A2P2O60397 106 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 RHOHQ15669 191 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 MORN5Q5VZ52 161 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 PMS2CLQ68D20 193 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.47□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 H0YGG7 62 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 FSTL3O95633 263 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 CCL5P13501 91 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 Q1RN00 199 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.46□□□□□ -1.37
USP3-211ENST00000559257 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 LAGE3Q14657 143 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 S1PR3Q99500 378 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.46□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 CD69Q07108 199 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 GFRALQ6UXV0 394 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP3-211ENST00000559257 PRR25Q96S07 402 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 SMKR1H3BMG3 65 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 IGLV2-11P01706 119 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.45□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 H7BZZ5 65 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 NUP37Q8NFH4 326 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RNF185Q96GF1 192 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 Q9UF83 564 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 PAX4O43316 350 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 BCE1O60756 84 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 PRSS12P56730 875 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.44□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 FAM223BA6NKX1 122 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 CCL21O00585 134 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 NGFP01138 241 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 XCL1P47992 114 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 MSMPQ1L6U9 139 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 C2orf83Q53S99 150 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 FAM27BQ5VT28 67 aa6.43□□□□□ -1.38
USP3-211ENST00000559257 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.43□□□□□ -1.38
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