RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SERF2P84101 59 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC21Q5SSG8 566 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 SGK494Q96LW2 274 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.11□□□□□ -0.31
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SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.08□□□□□ -0.32
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SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.07□□□□□ -0.32
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR5I1Q13606 314 aa13.06□□□□□ -0.32
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SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf49Q96NF6 230 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.06□□□□□ -0.32
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SH3BP2-218ENST00000511185 MDFICQ9P1T7 246 aa13.05□□□□□ -0.32
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SH3BP2-218ENST00000511185 RNF212Q495C1 297 aa13.02□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 TYMSP04818 313 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZR54 194 aa13□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV34A0A0B4J273 112 aa12.99□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa12.99□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 GNRH2O43555 120 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRG1Q3Y452 100 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PRNTQ86SH4 94 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP2-218ENST00000511185 PKD1P98161 4303 aa12.97□□□□□ -0.33
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