RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1QBP02746 253 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 FHITP49789 147 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMED6Q8WW62 240 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM210BQ96KR6 192 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.63□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1W2PRE2 83 aa13.62□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 STOML3Q8TAV4 291 aa13.62□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.62□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 UMAD1C9J7I0 102 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCRAP04437 139 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2G2P60604 165 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.61□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 DEFB130BP0DP73 79 aa13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 DEFB130AP0DP74 79 aa13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZQT7 251 aa13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBY3A6NI87 242 aa13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 EPDR1Q9UM22 224 aa13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 NACAE9PAV3 2078 aa13.59□□□□□ -0.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM74A7A6NL05 159 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNURFLB1AK76 121 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EQM0 130 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RGS13O14921 159 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SGK494Q96LW2 274 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATG101Q9BSB4 218 aa13.58□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GVG6 124 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 F6UZH7 168 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6AWC8 147 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TVP23CQ96ET8 276 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TREM1Q9NP99 234 aa13.57□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 F5H768 121 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFNA7P01567 189 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.56□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GV50 99 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV2-11P01706 119 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 MUC21Q5SSG8 566 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PSG8Q9UQ74 426 aa13.55□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PEX7O00628 323 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP5G1P05496 136 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP5G3P48201 142 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFP69Q49AA0 526 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC51BQ86UW2 128 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NAGKQ9UJ70 344 aa13.54□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.53□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCL1AP56279 114 aa13.53□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRNTQ86SH4 94 aa13.53□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.53□□□□□ -0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12BA1L429 117 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE7O76087 117 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12FP0CL80 117 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12GP0CL81 117 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 GAGE12IP0CL82 117 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 CST9LP1Q5W188 147 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q6ZTI0 123 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC00479Q96M42 142 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 C8orf49Q96NF6 230 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.52□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R2N4 97 aa13.51□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPT1P50897 306 aa13.51□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB5CP51148 216 aa13.51□□□□□ -0.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF415Q09FC8 603 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms