RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SHISA9	B4DS77	424 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE7	O76087	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE4	Q13068	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TCF15	Q12870	199 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	LINC01587	Q99440	93 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE5	Q13069	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE6	Q13070	117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574		B5MCH6	92 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	HIGD1B	Q9P298	99 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		M0R1W7	72 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	THBD	P07204	575 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GXF2	115 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C22orf46	C9J442	243 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	FCN3	O75636	299 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	ATP5J2	P56134	94 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		K7EMI3	77 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		J3QQQ9	107 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	COL8A2	P25067	703 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		Q9UFV3	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	CRP	P02741	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	PROP1	O75360	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	TEN1	Q86WV5	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	RASL10A	Q92737	203 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00158	P58513	81 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574		E7EQL1	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	MBD6	Q96DN6	1003 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	LY6H	O94772	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKD1-222	ENST00000496574	CFC1B	P0CG36	223 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	CFC1	P0CG37	223 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	DYSF	O75923	2080 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	FOXI1	Q12951	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	LHB	P01229	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKD1-222	ENST00000496574	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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