RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 TDRG1Q3Y452 100 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ATG101Q9BSB4 218 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GVG6 124 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TVP23CQ96ET8 276 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 CELA1Q9UNI1 258 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 CBY3A6NI87 242 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 F6UZH7 168 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ZFP69Q49AA0 526 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 PRM2P04554 102 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZTC4 211 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TREM1Q9NP99 234 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 PSG8Q9UQ74 426 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 LCE6AA0A183 80 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TEX46H3BTG2 121 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 BTN1A1Q13410 526 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 PRR9Q5T870 116 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 GNG5P63218 68 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 APLNQ9ULZ1 77 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-240ENST00000484412 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 IFNA7P01567 189 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 Q8TAT8 98 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 KCNS1Q96KK3 526 aa9.89□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 SNURFLB1AK76 121 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PEX7O00628 323 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 RGS13O14921 159 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 SPINK4O60575 86 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PAGE4O60829 102 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 HTN1P15515 57 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 EMP1P54849 157 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TCL1AP56279 114 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 DAD1P61803 113 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 SMUG1Q53HV7 270 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PTH2Q96A98 100 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 FMC1Q96HJ9 113 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 SPXQ9BT56 116 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 MANBALQ9NQG1 85 aa9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 J3KRW8 73 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 ATP5G1P05496 136 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 ATP5G3P48201 142 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2G2P60604 165 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 BLOC1S1P78537 153 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZQT7 251 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 RASL10AQ92737 203 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00479Q96M42 142 aa9.87□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 CCL20P78556 96 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 DNLZQ5SXM8 178 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 CST9LP1Q5W188 147 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 MLST8Q9BVC4 326 aa9.86□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 IGLL5B9A064 214 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 H3BNG1 76 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 LTAP01374 205 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PRNTQ86SH4 94 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 C11orf52Q96A22 123 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.3 ms