RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM231CP0DMU5 169 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GNG5P63218 68 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 SSX7Q7RTT5 188 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GVG6 124 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE12BA1L429 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE7O76087 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE12FP0CL80 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE12GP0CL81 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE12IP0CL82 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF726P1Q15940 193 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PRE2 83 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 BCL2L11O43521 198 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 PFDN1O60925 122 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TCRAP04437 139 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZQT7 251 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 STOML3Q8TAV4 291 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TREM1Q9NP99 234 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 EPDR1Q9UM22 224 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC11BP0C7V7 166 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 MUC21Q5SSG8 566 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6AWC8 147 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TMUB2Q71RG4 321 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 SGK494Q96LW2 274 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA7P01567 189 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TCL1AP56279 114 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2G2P60604 165 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP4-209ENST00000484097 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 GGTLC3B5MD39 225 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 UMAD1C9J7I0 102 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF415Q09FC8 603 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5I1Q13606 314 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZTI0 123 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP14Q86UN6 197 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 NAGKQ9UJ70 344 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PSG8Q9UQ74 426 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 HYDINQ4G0P3 5121 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 F6UZH7 168 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TVP23CQ96ET8 276 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 ATG101Q9BSB4 218 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT3O95989 172 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PRNTQ86SH4 94 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM74A7A6NL05 159 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SPINK4O60575 86 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 PPT1P50897 306 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP69Q49AA0 526 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 FHITP49789 147 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF212Q495C1 297 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SMUG1Q53HV7 270 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 CST9LP1Q5W188 147 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNS1Q96KK3 526 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 C8orf49Q96NF6 230 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 SPXQ9BT56 116 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 MDFICQ9P1T7 246 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-209ENST00000484097 PEX7O00628 323 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-209ENST00000484097 GCGP01275 180 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLV2-11P01706 119 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114 ms