RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481365.5

ATP6V1E1-208, Transcript of ATPase H+ transporting V1 subunit E1, human

TSL 4

Gene ATP6V1E1, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ZNF253	O75346	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	S100A7	P31151	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	GUK1	Q16774	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ESRG	Q1W209	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		E5RGE8	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MPC2	O95563	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	CRISP2	P16562	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	LEP	P41159	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	HBG1	P69891	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	HBG2	P69892	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	OR5I1	Q13606	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RAB31	Q13636	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		A0A096LPF7	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SPINK4	O60575	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MPDU1	O75352	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		Q5BKY6	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ATP5S	Q99766	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PRAF2	O60831	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PFDN1	O60925	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RLN2	P04090	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	GPX1	P07203	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TCL1A	P56279	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RAB2A	P61019	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SST	P61278	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	GNG5	P63218	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	PDE6H	Q13956	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		Q9H3A6	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SSNA1	O43805	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	OR7C2	O60412	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	M6PR	P20645	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365		Q9H8V8	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V1E1-208	ENST00000481365	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 303.9 ms