RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.16□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 ATG101Q9BSB4 218 aa13.16□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 A0A1B0GV50 99 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 FAM74A7A6NL05 159 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 RGS13O14921 159 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 PRR9Q5T870 116 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.15□□□□□ -0.3
DDR1-241ENST00000460944 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 CBY3A6NI87 242 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 SNURFLB1AK76 121 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 DAD1P61803 113 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 SGK494Q96LW2 274 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TREM1Q9NP99 234 aa13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 F6UZH7 168 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 SULT1A2P50226 295 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PPT1P50897 306 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 CST9LP1Q5W188 147 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PSG8Q9UQ74 426 aa13.13□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TEX46H3BTG2 121 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PEX7O00628 323 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 Q6AWC8 147 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PAGE4O60829 102 aa13.11□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.11□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 PRNTQ86SH4 94 aa13.11□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.1□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 DEFB130BP0DP73 79 aa13.1□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 DEFB130AP0DP74 79 aa13.1□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TVP23CQ96ET8 276 aa13.1□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 LCE6AA0A183 80 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 IGLL5B9A064 214 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 HTN3P15516 51 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 ATP5G3P48201 142 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TCTAP57738 103 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 MUC21Q5SSG8 566 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 NAGKQ9UJ70 344 aa13.09□□□□□ -0.31
DDR1-241ENST00000460944 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 IGLV2-11P01706 119 aa13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 UBE2G1P62253 170 aa13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 Q6ZQT7 251 aa13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 MANBALQ9NQG1 85 aa13.08□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 AKR1C3P42330 323 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 ZNF415Q09FC8 603 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 SMUG1Q53HV7 270 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 Q86TA4 180 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 FMC1Q96HJ9 113 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 LINC00479Q96M42 142 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 C8orf49Q96NF6 230 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.07□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GCGP01275 180 aa13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TCL1AP56279 114 aa13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GNG13Q9P2W3 67 aa13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.06□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 IFNA1P01562 189 aa13.05□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 ATP5G1P05496 136 aa13.05□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 ALKAL2Q6UX46 152 aa13.05□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAGE12BA1L429 117 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAGE7O76087 117 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAGE12FP0CL80 117 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAGE12GP0CL81 117 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 GAGE12IP0CL82 117 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 KCNS1Q96KK3 526 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 FAM210BQ96KR6 192 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.04□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 LYSTQ99698 3801 aa13.03□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.03□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 CCL20P78556 96 aa13.03□□□□□ -0.32
DDR1-241ENST00000460944 TDRG1Q3Y452 100 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms