RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 DKK2Q9UBU2 259 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SYNJ2BPP57105 145 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 CITED1Q99966 193 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SIVA1O15304 175 aa8.87□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 HLA-DRB4P13762 266 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 INSP01308 110 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB131AP59861 70 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.86□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 KNCNA6PVL3 124 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 DPH3Q96FX2 82 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 COL4A3Q01955 1670 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A087WX48 190 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 TAL2Q16559 108 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 CEND1Q8N111 149 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB125Q8N687 156 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 JPT2Q9H910 190 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.85□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 K7ERJ3 54 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 LEPROTO15243 131 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 GNLYP22749 145 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SPG11Q96JI7 2443 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 SAP30O75446 220 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 DYSFO75923 2080 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 H3BMG7 143 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 ATRXP46100 2492 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 HLA-DMBP28068 263 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 MORN5Q5VZ52 161 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 CTSZQ9UBR2 303 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.84□□□□□ -0.99
SEMA4D-211ENST00000438547 I3L3M4 83 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 NDUFA4O00483 81 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 LHBP01229 141 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 PATE2Q6UY27 113 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 AMTNQ6UX39 209 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 PCP2Q8IVA1 136 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 RHODO00212 210 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV1-69P01742 117 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 SPRNQ5BIV9 151 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.83□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 TCF15Q12870 199 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 C20orf78Q9BR46 151 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 FGF6P10767 208 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 GP9P14770 177 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 C12orf74Q32Q52 190 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGLV2-14P01704 120 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.82□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 EP400Q96L91 3159 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 C22orf46C9J442 243 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 H3BMM0 161 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 UBE2WQ96B02 151 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 K7ENP7 123 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 MSMBP08118 114 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.81□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 IGKV1-17P01599 117 aa8.8□□□□□ -1
SEMA4D-211ENST00000438547 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms