RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZWC4 215 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF479Q96JC4 524 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SMKR1H3BMG3 65 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 NCR2O95944 276 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C16orf92Q96LL3 132 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP5G2Q06055 141 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HBBP68871 147 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 NPFFO15130 113 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR3DS1Q14943 382 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C18orf15Q96N68 181 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 A4D1N5 150 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV4-39P01824 125 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 I3L2K1 104 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR2DL5AQ8N109 375 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 CD5LO43866 347 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 OTORQ9NRC9 128 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf52Q96A22 123 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TSKUQ8WUA8 353 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM213A2RRL7 107 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 M0QXV9 152 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 EVI2AP22794 236 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP8Q8NA92 274 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 KLK15Q9H2R5 256 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF6BO95407 300 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 FMC1Q96HJ9 113 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 METTL26Q96S19 204 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 VGLL1Q99990 258 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 M0R1W7 72 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV2-8P01709 118 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 Q86TA4 180 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 BLCAPP62952 87 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 ZANQ9Y493 2812 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 FNDC10F2Z333 226 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 GP9P14770 177 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PS18 150 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 RIGQ13278 110 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC11AP67812 179 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 AMTNQ6UX39 209 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GUT8 65 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CKS2P33552 79 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 PVRIGQ6DKI7 326 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 ITPR1Q14643 2758 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 HERVK_113P61574 105 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 M0R381 172 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 AMN1Q8IY45 258 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CUBNO60494 3623 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 MGPP08493 103 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 COX6B1P14854 86 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms