RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 CXorf1O96002 111 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE12FP0CL80 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE12GP0CL81 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE12IP0CL82 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 FHITP49789 147 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF345Q14585 488 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZTI0 123 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 F6UZH7 168 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-11P01706 119 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 TCRAP04437 139 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 HOXA5P20719 270 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 MUC21Q5SSG8 566 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 Q6AWC8 147 aa7.53□□□□□ -1.2
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ATG4B-210ENST00000428861 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 TMED6Q8WW62 240 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 FAM210BQ96KR6 192 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-210ENST00000428861 SNURFLB1AK76 121 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 RGS13O14921 159 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 SPINK4O60575 86 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5G1P05496 136 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5G3P48201 142 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TCL1AP56279 114 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2G2P60604 165 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00479Q96M42 142 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf49Q96NF6 230 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 MDFICQ9P1T7 246 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PRE2 83 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 BCL2L11O43521 198 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 EPDR1Q9UM22 224 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 PSG8Q9UQ74 426 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0D9SG52 128 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.5□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TREM1Q9NP99 234 aa7.5□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 NUDT3O95989 172 aa7.49□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.49□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.48□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-53P01767 116 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TYMSP04818 313 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TDRG1Q3Y452 100 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.48□□□□□ -1.21
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ATG4B-210ENST00000428861 ATG101Q9BSB4 218 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 NACAE9PAV3 2078 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GV50 99 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 M0R2N4 97 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 PEX7O00628 323 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-210ENST00000428861 GCGP01275 180 aa7.47□□□□□ -1.21
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