RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264719.5

EFR3B-201, Transcript of EFR3 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene EFR3B, Length 1,980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3B-201ENST00000264719 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.98□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF124Q15973 351 aa11.97□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF575Q86XF7 245 aa11.97□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 FRZBQ92765 325 aa11.97□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.97□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 A8MWL6 223 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 IGKV3-20P01619 116 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 RAB5BP61020 215 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 CT83Q5H943 113 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.96□□□□□ -0.49
EFR3B-201ENST00000264719 PAFAH1B2P68402 229 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 LINC00477Q96M19 166 aa11.96□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 VWFP04275 2813 aa11.95□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.95□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.95□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.95□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 A0A0J9YX75 114 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TMEM189A5PLL7 270 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TPPP3Q9BW30 176 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SORL1Q92673 2214 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 PCP4L1A6NKN8 68 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BKO60814 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SAP30O75446 220 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ORM1P02763 201 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BJP06899 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TRGC1P0CF51 173 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BOP23527 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BBP33778 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BDP58876 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 DEFB131AP59861 70 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BCP62807 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ATRQ13535 2644 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 A0A1B0GUS0 222 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 KNCNA6PVL3 124 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SSTP61278 116 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 MUC21Q5SSG8 566 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.93□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SNURFLB1AK76 121 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 CAMPP49913 170 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 RAB4BP61018 213 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.92□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 PF4P02776 101 aa11.91□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 GPX1P07203 203 aa11.91□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.91□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 M0R2Z0 102 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 A0A1B0GXF2 115 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 LINC01559Q495D7 138 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 CITED1Q99966 193 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 NAGKQ9UJ70 344 aa11.9□□□□□ -0.5
EFR3B-201ENST00000264719 AGRNO00468 2067 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 FAM231BA6NCW3 169 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 CRISP2P16562 243 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.89□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 OR4C46A6NHA9 309 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 KLLNB2CW77 178 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 FXYD7P58549 80 aa11.88□□□□□ -0.51
EFR3B-201ENST00000264719 SLAQ13239 276 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.9 ms