RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 BPTFQ12830 3046 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 HLA-DMBP28068 263 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 A0A087WX48 190 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.95□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SRD5A1P18405 259 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 FOXI1Q12951 378 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 TMEM131Q92545 1883 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 KLRD1Q13241 179 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SPRNQ5BIV9 151 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 NACAE9PAV3 2078 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 K7EM74 188 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 CD28P10747 220 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.94□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 H3BRN7 92 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 A0A087WWL8 130 aa11.93□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 UTF1Q5T230 341 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SPXQ9BT56 116 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 HIGD1BQ9P298 99 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 H3BMM0 161 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 UBE2WQ96B02 151 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 VCYO14598 125 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SPRY2O43597 315 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 Q8N7P7 452 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.92□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 CCL21O00585 134 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 EDA2RQ9HAV5 297 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 NPFFO15130 113 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 ODF1Q14990 250 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 ZNF876PQ49A33 203 aa11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 TEN1Q86WV5 123 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 COPS9Q8WXC6 57 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 RNF183Q96D59 192 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.9□□□□□ -0.5
CASC3-201ENST00000264645 IGKV1-17P01599 117 aa11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 TMEM101Q96IK0 257 aa11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 GATA4P43694 442 aa11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 RNF5Q99942 180 aa11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 PAX8Q06710 450 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 MLST8Q9BVC4 326 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 MT-ATP8P03928 68 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 PMVKQ15126 192 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 C3orf56Q8N813 242 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 RITA1Q96K30 269 aa11.88□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 SHISA9B4DS77 424 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 VWC2LB2RUY7 222 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 LY6HO94772 140 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGLV1-44P01699 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGHG3P01860 377 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 FOXC1Q12948 553 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.87□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.86□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 OVOL1O14753 267 aa11.86□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.86□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 J3QQQ9 107 aa11.86□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.86□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 SORL1Q92673 2214 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 ZNF883P0CG24 379 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 CFHR4Q92496 578 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 UBE2L6O14933 153 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.85□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.84□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 E9PLD3 99 aa11.84□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.84□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 LINC00477Q96M19 166 aa11.84□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 Q6ZUT4 128 aa11.84□□□□□ -0.51
CASC3-201ENST00000264645 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms