RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR52E5	Q8NH55	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	RABAC1	Q9UI14	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PRE2	83 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		H0Y8G0	127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LY6L	H3BQJ8	138 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BLCAP	P62952	87 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	AES	Q08117	197 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FA2H	Q7L5A8	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	DRAM1	Q8N682	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MGST2	Q99735	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OOSP1	A8MZH6	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MPDU1	O75352	247 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FABP2	P12104	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NUP35	Q8NFH5	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		J3QR89	54 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A17	O43808	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CAMP	P49913	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	UTF1	Q5T230	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR11H1	Q8NG94	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR11H2	Q8NH07	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CD24	P25063	80 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ATP5G2	Q06055	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	WFDC2	Q14508	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TEX45	Q8NA69	505 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR9G1	Q8NH87	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	VGLL1	Q99990	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CALY	Q9NYX4	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	JPT1	Q9UK76	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PSG8	Q9UQ74	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GXF2	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	GGTLC3	B5MD39	225 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-7	P01780	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	CRYGC	P07315	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR5AL1	P0C617	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00596	Q86U02	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PPI3	338 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	HIGD1C	A8MV81	97 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	PSG5	Q15238	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	NCR2	O95944	276 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	INSL3	P51460	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FGD4-215	ENST00000551984	ETDB	Q3ZM63	59 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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