RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549944.1

ZDHHC17-208, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 17, human

TSL 5

Gene ZDHHC17, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZDHHC17-208	ENST00000549944	MEOX2	P50222	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CCR6	P51684	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	FCN2	Q15485	313 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TRGV9	Q99603	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	VCX2	Q9H322	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944		A0A0B4J2A0	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	RGS5	O15539	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	AKR1C4	P17516	323 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	AZU1	P20160	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CCL18	P55774	89 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	PRRT1	Q99946	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ATP5G1	P05496	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	HTN1	P15515	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ORM2	P19652	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TSPO	P30536	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ATP5G3	P48201	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SRPX	P78539	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	FGL1	Q08830	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CLINT1	Q14677	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944		A0A087X002	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	PITX3	O75364	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	PPT1	P50897	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	RAB11A	P62491	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	IL18	Q14116	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SPCS2	Q15005	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	LINC01587	Q99440	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	FAT1	Q14517	4588 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944		A0A0J9YY99	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944		H3BP45	60 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944		H3BRN7	92 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ANXA3	P12429	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TAS2R60	P59551	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	B2M	P61769	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	RHOB	P62745	196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	OR5I1	Q13606	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	GPR82	Q96P67	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	WRB	O00258	174 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	SYNGR2	O43760	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZDHHC17-208	ENST00000549944	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms