RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 PHYHIPLQ96FC7 376 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 Q9H3A6 140 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 APLNQ9ULZ1 77 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 TNFSF18Q9UNG2 199 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 GPX1P07203 203 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V0CP27449 155 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 NMBP08949 121 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF503Q96F45 646 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM210BQ96KR6 192 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 C7orf71A4D174 169 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 TAAR5O14804 337 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB130BP0DP73 79 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB130AP0DP74 79 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 KIR3DS1Q14943 382 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 HYLS1Q96M11 299 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 OTORQ9NRC9 128 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-210ENST00000505941 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RBAKDNA6NC62 111 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SNURFLB1AK76 121 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF138P52744 262 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 VGLL1Q99990 258 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF222A6NCQ9 220 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PGPA6NDG6 321 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARPC5O15511 151 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF492Q9P255 531 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CRISP2P16562 243 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB24Q969Q5 203 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RYR2Q92736 4967 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 KLLNB2CW77 178 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 DIRC3C9JPN6 131 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CBY3A6NI87 242 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CXorf1O96002 111 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP5G1P05496 136 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 STAG3L2P0CL84 134 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 STAG3L3P0CL85 134 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 P0DMU3 169 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM231AP0DMU4 169 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM231CP0DMU5 169 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP5G3P48201 142 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 BTN1A1Q13410 526 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 RGS13O14921 159 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 CD300CQ08708 224 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-210ENST00000505941 F5H768 121 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 K7EQM0 130 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GCHFRP30047 84 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 Q8TAT8 98 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMED6Q8WW62 240 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SMLR1H3BR10 107 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 G3V3Q6 166 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GAGE12BA1L429 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 HMSDA8MTL9 139 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GAGE7O76087 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GAGE12FP0CL80 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-210ENST00000505941 GAGE12GP0CL81 117 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.9 ms