RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493316.5

CFAP74-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 74, human

TSL 4

Gene CFAP74, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP74-208	ENST00000493316	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	RNF141	Q8WVD5	230 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PRELID1	Q9Y255	219 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C7orf71	A4D174	169 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	KLLN	B2CW77	178 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SSNA1	O43805	119 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	BTN1A1	Q13410	526 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ICAM4	Q14773	271 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C16orf90	A8MZG2	172 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GAGE7	O76087	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	MPC2	O95563	127 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	OR10J4	P0C629	311 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PET100	P0DJ07	73 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	CRISP2	P16562	243 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	HOXA5	P20719	270 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	DEFA1	P59665	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	DEFA3	P59666	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	CD300C	Q08708	224 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PRR9	Q5T870	116 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316		Q6ZTI0	123 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP5S	Q99766	215 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	PAXX	Q9BUH6	204 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	OR51M1	Q9H341	326 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	MBD2	Q9UBB5	411 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	HSPB11	Q9Y547	144 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	OR7C2	O60412	319 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	M6PR	P20645	277 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	CCL18	P55774	89 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TNP2	Q05952	138 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	OR5I1	Q13606	314 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316		Q8TAT8	98 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	VGLL1	Q99990	258 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316		A0A0J9YY99	117 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	GPX1	P07203	203 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF492	Q9P255	531 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CFAP74-208	ENST00000493316	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.34	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms