RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 C16orf92Q96LL3 132 aa9.66□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.66□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 A0A0J9YY99 117 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 M0R2Z0 102 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 CXCL2P19875 107 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.65□□□□□ -0.86
STX4-209ENST00000486660 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 GCSHP23434 173 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 OR5I1Q13606 314 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 LCN15Q6UWW0 184 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 C20orf173Q96LM9 149 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 AQP10Q96PS8 301 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 RPRMQ9NS64 109 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.64□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 A0A087WTM6 91 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TSPOP30536 169 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 ZNF266Q14584 549 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 MORN5Q5VZ52 161 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 BAP18Q8IXM2 172 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.63□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 A8MTW9 85 aa9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 INSP01308 110 aa9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 GUK1Q16774 197 aa9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 IGLC2P0DOY2 106 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 M6PRP20645 277 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 HOXA5P20719 270 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 Q5BKY6 102 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.61□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 RNF182Q8N6D2 247 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 ZNF738Q8NE65 137 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 WFDC1Q9HC57 220 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.6□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 RNF222A6NCQ9 220 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 ZNF253O75346 499 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 HTN1P15515 57 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 FUT9Q9Y231 359 aa9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
STX4-209ENST00000486660 G3V3Q6 166 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 H3BQ15 152 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 SLC17A3O00476 420 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 SIVA1O15304 175 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 PDE6HQ13956 83 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 PSG3Q16557 428 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 LINC01587Q99440 93 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.58□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 TAS2R45P59539 299 aa9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 RHOBP62745 196 aa9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 C16orf74Q96GX8 76 aa9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.57□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 H3BTX0 84 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 ARPC5O15511 151 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 PYYP10082 97 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 KHDC3LQ587J8 217 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.56□□□□□ -0.88
STX4-209ENST00000486660 A0A096LPF7 62 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms