RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880		Q9H3A6	140 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	SNURFL	B1AK76	121 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	GPX1	P07203	203 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	VGLL1	Q99990	258 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.52	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf71	A4D174	169 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880		F5H768	121 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880		Q8TAT8	98 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	CBY3	A6NI87	242 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	CD300C	Q08708	224 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	OXA1L	Q15070	435 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PGP	A6NDG6	321 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE7	O76087	117 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5G1	P05496	136 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12F	P0CL80	117 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12G	P0CL81	117 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE12I	P0CL82	117 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880		P0DMU3	169 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5G3	P48201	142 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF138	P52744	262 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RGS13	O14921	159 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC5	O15511	151 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT3	O95989	172 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	KLLN	B2CW77	178 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	MB	P02144	154 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	OR5I1	Q13606	314 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	PRR9	Q5T870	116 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ATG101	Q9BSB4	218 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880		M0R2N4	97 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GNG5	P63218	68 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	SERF2	P84101	59 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	CRISP2	P16562	243 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf1	O96002	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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