RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ODF3Q96PU9 254 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 VGLL1Q99990 258 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TREM1Q9NP99 234 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PSG8Q9UQ74 426 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MTW9 85 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MZ25 164 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPOP30536 169 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LEPP41159 167 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF138P52744 262 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFA5Q16718 116 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CITED4Q96RK1 184 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF492Q9P255 531 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3-20P01619 116 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV2-11P01706 119 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 AMBPP02760 352 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CT45A10P0DMU9 189 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CEBPGP53567 150 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRNTQ86SH4 94 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00479Q96M42 142 aa6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 C9JQL5 133 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CRISP2P16562 243 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN1BP46527 198 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG4P50150 75 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 APOC4P55056 127 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 AMTNQ6UX39 209 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 Q86TA4 180 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 BAGE2Q86Y30 109 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8TAT8 98 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM12Q96EX1 92 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SGK494Q96LW2 274 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CSTL1Q9H114 145 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PARLQ9H300 379 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 NOTCH1P46531 2555 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF727A8MUV8 499 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 C9JCJ5 164 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LTAP01374 205 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DERL1Q9BUN8 251 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 BIN3Q9NQY0 253 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 AGRNO00468 2067 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM218A2RU14 115 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EIL1 84 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2CO00762 179 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 GPX1P07203 203 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SFTA3P0C7M3 94 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SMUG1Q53HV7 270 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPWQ5EE01 88 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TVP23CQ96ET8 276 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DNHD1Q96M86 4753 aa6.9□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.9□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf71A4D174 169 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KLLNB2CW77 178 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2Z0 102 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 INSP01308 110 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 FXYD7P58549 80 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.89□□□□□ -1.31
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