RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 LEPP41159 167 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 CSN1S1P47710 185 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 GNG5P63218 68 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 CD300CQ08708 224 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 BTN1A1Q13410 526 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 ZNF345Q14585 488 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 C12orf74Q32Q52 190 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.68□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 Q6ZQT7 251 aa14.68□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 PRR9Q5T870 116 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 LINC00477Q96M19 166 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 OTORQ9NRC9 128 aa14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 DIRC3C9JPN6 131 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 BCL2L11O43521 198 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 PFDN1O60925 122 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 FHITP49789 147 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 TMUB2Q71RG4 321 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 DKK2Q9UBU2 259 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 A0A0D9SG52 128 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 A0A1B0GVG6 124 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 TMEM189A5PLL7 270 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 CXorf1O96002 111 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 SGK494Q96LW2 274 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 ODF3Q96PU9 254 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 ZNF492Q9P255 531 aa14.66□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.65□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTX4-203ENST00000447419 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C7orf71A4D174 169 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 IGLL5B9A064 214 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 H7BYZ3 331 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 GPX1P07203 203 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 HTN3P15516 51 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 ZNF138P52744 262 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TAS2R60P59551 318 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 UBE2G2P60604 165 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.64□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 LCE6AA0A183 80 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.63□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 A0A1B0GV50 99 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 KLLNB2CW77 178 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 AKAP14Q86UN6 197 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 LYSTQ99698 3801 aa14.62□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 GGTLC3B5MD39 225 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 DEFB130BP0DP73 79 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 DEFB130AP0DP74 79 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TMED6Q8WW62 240 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 SUN5Q8TC36 379 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.61□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 RBAKDNA6NC62 111 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 CRISP2P16562 243 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 DAD1P61803 113 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C16orf74Q96GX8 76 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.6□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 RYR2Q92736 4967 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C11orf94C9JXX5 98 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 F6UZH7 168 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 LY6G6CO95867 125 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.59□□□□□ -0.07
PTX4-203ENST00000447419 C1QBP02746 253 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 SEC11BP0C7V7 166 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 MUC21Q5SSG8 566 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.58□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 TVP23CQ96ET8 276 aa14.57□□□□□ -0.08
PTX4-203ENST00000447419 CBY3A6NI87 242 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms