RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.88□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRM2P04554 102 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPX1P07203 203 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP6V0CP27449 155 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB2AP61019 212 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HYLS1Q96M11 299 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RYR2Q92736 4967 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C7orf71A4D174 169 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNURFLB1AK76 121 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAAR5O14804 337 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARPC5O15511 151 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB130BP0DP73 79 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB130AP0DP74 79 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AZU1P20160 251 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF503Q96F45 646 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM210BQ96KR6 192 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OTORQ9NRC9 128 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APLNQ9ULZ1 77 aa8.86□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBAKDNA6NC62 111 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PGPA6NDG6 321 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NMBP08949 121 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF138P52744 262 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIR3DS1Q14943 382 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VGLL1Q99990 258 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF492Q9P255 531 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.85□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF222A6NCQ9 220 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB24Q969Q5 203 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CBY3A6NI87 242 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLLNB2CW77 178 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DIRC3C9JPN6 131 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RGS13O14921 159 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CXorf1O96002 111 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP5G1P05496 136 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STAG3L2P0CL84 134 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STAG3L3P0CL85 134 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 P0DMU3 169 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM231AP0DMU4 169 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM231CP0DMU5 169 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRISP2P16562 243 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP5G3P48201 142 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BTN1A1Q13410 526 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.83□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 F5H768 121 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 K7EQM0 130 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD300CQ08708 224 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q8TAT8 98 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.82□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMLR1H3BR10 107 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GCHFRP30047 84 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.81□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMED6Q8WW62 240 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.8□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0D9SG52 128 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAGE12BA1L429 117 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 G3V3Q6 166 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAGE7O76087 117 aa8.79□□□□□ -1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAGE12FP0CL80 117 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms