RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 H0YIZ8 118 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 H3BQ15 152 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 H7BYZ3 331 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 M0R2Z0 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SLC17A3O00476 420 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 MPC2O95563 127 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NMBP08949 121 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RHOBP62745 196 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NHLH2Q02577 135 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 BAP18Q8IXM2 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ASB13Q8WXK3 278 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 C16orf74Q96GX8 76 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PTTG1O95997 202 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LEPP41159 167 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LINC00477Q96M19 166 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ATP5SQ99766 215 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 HSPB11Q9Y547 144 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SSNA1O43805 119 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NDUFB4O95168 129 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SIX6O95475 246 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 EMP1P54849 157 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 DAD1P61803 113 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RNF212Q495C1 297 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 CBY3A6NI87 242 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 KLLNB2CW77 178 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 CRISP2P16562 243 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 CLINT1Q14677 625 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 THAP6Q8TBB0 222 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 C18orf15Q96N68 181 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LINC01587Q99440 93 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 OR51M1Q9H341 326 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FUT9Q9Y231 359 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 RBAKDNA6NC62 111 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PRAC2D3DTV9 90 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 IFNA5P01569 189 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 CT45A10P0DMU9 189 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 TAS2R45P59539 299 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FXYD5Q96DB9 178 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 NACAE9PAV3 2078 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 H3BNG1 76 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 M0R3E3 92 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ATP5G1P05496 136 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 PYYP10082 97 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 AZU1P20160 251 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ATP5G3P48201 142 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-218ENST00000629219 ZNF266Q14584 549 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms