RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	DNAH2	Q9P225	4427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1B0GVG6	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061		H3BTX0	84 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	FGF7	P21781	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ILF3-223	ENST00000593061	DAD1	P61803	113 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	OPCML	Q14982	345 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZRG5	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	IFNA5	P01569	189 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061		P0DMU3	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	CXCL2	P19875	107 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	SLC17A3	O00476	420 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	ARPC5	O15511	151 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	WFDC1	Q9HC57	220 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	B2M	P61769	119 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	LINC01587	Q99440	93 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	HTN1	P15515	57 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF266	Q14584	549 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	PFDN5	Q99471	154 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061		H3BQ15	152 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	AZU1	P20160	251 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ILF3-223	ENST00000593061	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	CDKN1B	P46527	198 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF345	Q14585	488 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TAAR5	O14804	337 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	C1QB	P02746	253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TSPO	P30536	169 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0D9SG52	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061		M0R2N4	97 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TAS2R60	P59551	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061		J3KRW8	73 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	GUK1	Q16774	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	CD300C	Q08708	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ILF3-223	ENST00000593061		F5H768	121 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061		H7BYZ3	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	PYY	P10082	97 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 288 ms