RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CCR6P51684 374 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PLP1P60201 277 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RAP2BP61225 183 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RND3P61587 244 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C2orf83Q53S99 150 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF738Q8NE65 137 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CNBD2Q96M20 576 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TP53RKQ96S44 253 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 MDFICQ9P1T7 246 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0G2JRQ6 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 FAM229AH3BQW9 127 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 DLEU1O43261 78 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 NXPH3O95157 252 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PI3P19957 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CRYBA4P53673 196 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PIGPP57054 158 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00315P59091 139 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 NHLH2Q02577 135 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR5I1Q13606 314 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 AMTNQ6UX39 209 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 UPK3BQ9BT76 320 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CENPXA8MT69 81 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 A8MTW9 85 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 M0R2Z0 102 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 HOXB5P09067 269 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 AZU1P20160 251 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ERVFC1-1P60608 527 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ESRGQ1W209 222 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SP6Q3SY56 376 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 UQCC3Q6UW78 93 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 NOXA1Q86UR1 476 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR52E5Q8NH55 327 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SFRP2Q96HF1 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf173Q96LM9 149 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C17orf77Q96MU5 243 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01587Q99440 93 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0J9YY99 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf170A2RU37 121 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP92A6NM28 416 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 PRAF2O60831 178 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 HSBP1O75506 76 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 HTN1P15515 57 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ELK1P19419 428 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 GABARAPL2P60520 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 LYZP61626 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ICAM4Q14773 271 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 BAP18Q8IXM2 172 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF503Q96F45 646 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 BIN3Q9NQY0 253 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 COPZ2Q9P299 210 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 K7EP13 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 GALR1P47211 349 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-1P60331 282 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RAB2AP61019 212 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 RANP62826 216 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF90Q03938 601 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZSN1 163 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 LGI3Q8N145 548 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.28□□□□□ -1.4
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