RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RARRES2Q99969 163 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 HSPB11Q9Y547 144 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 AGRNO00468 2067 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YWU9 116 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 H3BTX0 84 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 C4BPBP20851 252 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 HLA-DMBP28068 263 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RNF182Q8N6D2 247 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 OR11H2Q8NH07 326 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 WFDC1Q9HC57 220 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RPRMQ9NS64 109 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PKHD1P08F94 4074 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MPDU1O75352 247 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SPP1P10451 314 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 HLA-DRB4P13762 266 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FAM78BQ5VT40 261 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 EBLN2Q6P2I7 272 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF709Q8N972 641 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 NUDT10Q8NFP7 164 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 NUDT11Q96G61 164 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PFDN5Q99471 154 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ATP5SQ99766 215 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 XCL2Q9UBD3 114 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RNF24Q9Y225 148 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 RFNGQ9Y644 331 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 A0A087X0K7 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YX75 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 CXorf65A6NEN9 183 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 H3BQ15 152 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 DEFB4AO15263 64 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 IFNA5P01569 189 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PCP4P48539 62 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF738Q8NE65 137 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MUC4Q99102 2169 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PSG9Q00887 426 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PSG3Q16557 428 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SLC17A3O00476 420 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 IGLC2P0DOY2 106 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 PYYP10082 97 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 LCN15Q6UWW0 184 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 BLNKQ8WV28 456 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 MFFQ9GZY8 342 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 HRH4Q9H3N8 390 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-217ENST00000550044 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 NUPR2A6NF83 97 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 SMLR1H3BR10 107 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 RHOBP62745 196 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 AQP10Q96PS8 301 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 PRAC2D3DTV9 90 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-217ENST00000550044 OR10J4P0C629 311 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms