RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC17A3	O00476	420 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	PHOX2A	O14813	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	TPPP2	P59282	170 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35B1	P78383	322 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR82	Q96P67	336 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	CFHR3	Q02985	330 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	UBE2C	O00762	179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	LTA	P01374	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	PSG9	Q00887	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	FRZB	Q92765	325 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF253	O75346	499 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BD	P58876	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BC	P62807	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		K7EQM0	130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHG4	P01861	327 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		Q86TA4	180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	METTL26	Q96S19	204 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A087X0K7	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A0G2JLM5	398 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		M0QZ24	198 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	BUB3	O43684	328 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	PF4V1	P10720	104 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ARL3	P36405	182 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508		U3KQE9	123 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	PSMB8	P28062	276 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA6	P56556	154 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXE3	Q13461	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NUDT11	Q96G61	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	CSN1S1	P47710	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA4	O00483	81 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ELANE	P08246	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	HOXA5	P20719	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	AKR1D1	P51857	326 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	PSG3	Q16557	428 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508		M0R3E3	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMEM18-208	ENST00000497508	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms