RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.17□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 VWFP04275 2813 aa8.17□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 DIRC3C9JPN6 131 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 K7EQM0 130 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CHEK1O14757 476 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CSN1S1P47710 185 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2G1P62253 170 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF212Q495C1 297 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 DPF1Q92782 380 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 ISOC2Q96AB3 205 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00479Q96M42 142 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF114Q9Y508 228 aa8.16□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 NOTCH1P46531 2555 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM213A2RRL7 107 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CXorf65A6NEN9 183 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 ISLRO14498 428 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV2-8P01709 118 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 CD28P10747 220 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 SYNJ2BPP57105 145 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 PROK1P58294 105 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 BAGE2Q86Y30 109 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 OR11H1Q8NG94 326 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM12Q96EX1 92 aa8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ECHDC3-204ENST00000495787 K7EN84 100 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R3E3 92 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R2P9O14990 202 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 GCGP01275 180 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SLURP1P55000 103 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB136Q30KP8 78 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GUS0 222 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf70A6NJV1 201 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 H7BYZ3 331 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 LTAP01374 205 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLV2-11P01706 119 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 PSG3Q16557 428 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 LCN12Q6JVE5 192 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 TCF24Q7RTU0 167 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 Q86TA4 180 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SFRP2Q96HF1 295 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 C16orf92Q96LL3 132 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 NRN1Q9NPD7 142 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 PEMTQ9UBM1 199 aa8.13□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 RBAKDNA6NC62 111 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 M0QZ24 198 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SOCS3O14543 225 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 EDN2P20800 178 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 CBLN1P23435 193 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 HLA-DMBP28068 263 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5I1Q13606 314 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 RAX2Q96IS3 184 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 SGK494Q96LW2 274 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 MLST8Q9BVC4 326 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 BIN3Q9NQY0 253 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 OSTCQ9NRP0 149 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 PSG8Q9UQ74 426 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.12□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PRX2 142 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 COLCA2A8K830 154 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 FOLR2P14207 255 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 FHL3Q13643 280 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 PRNTQ86SH4 94 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF182Q8N6D2 247 aa8.11□□□□□ -1.11
ECHDC3-204ENST00000495787 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms