RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 PSG9Q00887 426 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF345Q14585 488 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR11H2Q8NH07 326 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RNF141Q8WVD5 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GVG6 124 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PPV4 95 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TAAR5O14804 337 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TAS2R45P59539 299 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SERF2P84101 59 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PDE6HQ13956 83 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 KHDC3LQ587J8 217 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 X6R8D5 127 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 COL7A1Q02388 2944 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 M0R2Z0 102 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RGS13O14921 159 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 DEFB4AO15263 64 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 JTBO76095 146 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 CD300CQ08708 224 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ICAM4Q14773 271 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 SSX7Q7RTT5 188 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 MUC7Q8TAX7 377 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 TGP01266 2768 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 A0A0D9SG52 128 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 BCL2L11O43521 198 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 MBP02144 154 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 STAG3L2P0CL84 134 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 STAG3L3P0CL85 134 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RANP62826 216 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ZNF726P1Q15940 193 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 TMUB2Q71RG4 321 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 BAP18Q8IXM2 172 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 Q8NAQ8 132 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 RAB24Q969Q5 203 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 Q9H3A6 140 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 PRELID1Q9Y255 219 aa6.26□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 C1QBP02746 253 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 CT45A10P0DMU9 189 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ERCC8Q13216 396 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 KIR3DS1Q14943 382 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 AKAP14Q86UN6 197 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IL17DQ8TAD2 202 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 C3orf84H3BNL1 204 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 AMBPP02760 352 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 PRM2P04554 102 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 MIFP14174 115 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 GCHFRP30047 84 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 CDKN1BP46527 198 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 SUN5Q8TC36 379 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.24□□□□□ -1.41
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms