RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 PGPA6NDG6 321 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 K7EQM0 130 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 PDE6DO43924 150 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 PAGE4O60829 102 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 CCL20P78556 96 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 ICAM4Q14773 271 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GV50 99 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 RBAKDNA6NC62 111 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 OR11H12B2RN74 326 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 SLC17A3O00476 420 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 TFPI2P48307 235 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 CST9LP1Q5W188 147 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 EPDR1Q9UM22 224 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 COL7A1Q02388 2944 aa8.73□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 C11orf94C9JXX5 98 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 H3BTX0 84 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 UBE2G2P60604 165 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 PEA15Q15121 130 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 ZNF738Q8NE65 137 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
NISCH-211ENST00000488243 LINC00862A6NCI5 91 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 GGTLC3B5MD39 225 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TMEM250H0YL14 139 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ZNF688P0C7X2 276 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 PSMG4Q5JS54 123 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 UQCC3Q6UW78 93 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 LINC00477Q96M19 166 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 LINC00052Q96N35 136 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ATG101Q9BSB4 218 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 RYR2Q92736 4967 aa8.71□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 DIRC3C9JPN6 131 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 K7EIL1 84 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TCRAP04437 139 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 DEFB131AP59861 70 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 CD81P60033 236 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA5Q16718 116 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 HAGHQ16775 308 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 C11orf52Q96A22 123 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YX75 114 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 PEX7O00628 323 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ATP5G3P48201 142 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TOR2AQ5JU69 321 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 RNF182Q8N6D2 247 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 FMC1Q96HJ9 113 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 C20orf173Q96LM9 149 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ODF3Q96PU9 254 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 A8MTW9 85 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 M0R3E3 92 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 CD7P09564 240 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DRB4P13762 266 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R60P59551 318 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-211ENST00000488243 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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