RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GAGE12IP0CL82 117 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 GAGE4Q13068 117 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CFHR4Q92496 578 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RNF7Q9UBF6 113 aa6.08□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LINC01587Q99440 93 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DUSP13Q9UII6 198 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 OOEPA6NGQ2 149 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRSS46E5RG02 174 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 C15orf65H3BRN8 121 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A6P0DMU7 189 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A5P0DMU8 189 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A7P0DMV0 189 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CAMPP49913 170 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 Q96MF0 132 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RHODO00212 210 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FOXI1Q12951 378 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RTL8BQ17RB0 113 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RASL10AQ92737 203 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CARD19Q96LW7 228 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CTSZQ9UBR2 303 aa6.07□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TAS2R45P59539 299 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF747Q9BV97 191 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SIRPDQ9H106 197 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HIGD1CA8MV81 97 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 GGTLC3B5MD39 225 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 E9PLD3 99 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CA6P23280 308 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HBBP68871 147 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.06□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 C17orf98A8MV24 154 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 K7ERJ3 54 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 WNT9BO14905 357 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SPINK9Q5DT21 86 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 M0R1W7 72 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 NCR2O95944 276 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PSG5Q15238 335 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 H3BMG7 143 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TPPP3Q9BW30 176 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.05□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ODF3BA8MYP8 253 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HCP5Q6MZN7 132 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TEX29Q8N6K0 151 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CD177Q8N6Q3 437 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FZR1Q9UM11 496 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MGST3O14880 152 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR20EP86478 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR20CP86479 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR20DP86480 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR20BP86481 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRR20AP86496 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MKXQ8IYA7 352 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF503Q96F45 646 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 PRELID3AQ96N28 172 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TMEM213A2RRL7 107 aa6.04□□□□□ -1.44
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