RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A22Q9H936 323 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 RPRMQ9NS64 109 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0J9YX75 114 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 SMCO3A2RU48 225 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 A8MTW9 85 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 PEA15Q15121 130 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TEPPQ6URK8 271 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 PATE2Q6UY27 113 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM218A2RU14 115 aa9.51□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 F6UB75 175 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV3-20P01619 116 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.51□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 HLA-DMBP28068 263 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 PSG9Q00887 426 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 FAM78BQ5VT40 261 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 S100A7AQ86SG5 101 aa9.51□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TREM1Q9NP99 234 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 DOK5Q9P104 306 aa9.51□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 APLNQ9ULZ1 77 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 RNF24Q9Y225 148 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 RYR1P21817 5038 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087X0K7 114 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 AGPAT2O15120 278 aa9.49□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD7P58549 80 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 RAB31Q13636 194 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf74Q32Q52 190 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 AMTNQ6UX39 209 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZTC4 211 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 UHRF2Q96PU4 802 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 SEC11CQ9BY50 192 aa9.49□□□□□ -0.89
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C9orf3-210ENST00000462125 IFNA1P01562 189 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 GUK1Q16774 197 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 SVBPQ8N300 66 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 MGST2Q99735 147 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 CELA1Q9UNI1 258 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 RFNGQ9Y644 331 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf3-210ENST00000462125 F8W036 122 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 APOC3P02656 99 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 AMBPP02760 352 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 M6PRP20645 277 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PPT1P50897 306 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PRR20EP86478 221 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PRR20CP86479 221 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PRR20DP86480 221 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PRR20BP86481 221 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 PRR20AP86496 221 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 RNF182Q8N6D2 247 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 SNAPINO95295 136 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-210ENST00000462125 FHITP49789 147 aa9.45□□□□□ -0.9
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