RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00305Q7Z4B0 112 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CTAGE3PQ8IX95 158 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 IFT20Q8IY31 132 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 WFDC11Q8NEX6 87 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2BLQ99880 126 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 Q9BRP9 147 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCD10Q9BUL8 212 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CST9LQ9H4G1 147 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NIT2Q9NQR4 276 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM9Q9Y5J7 89 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 MCM3APO60318 1980 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 RIC1Q4ADV7 1423 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRB1O14514 1584 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 C20orf202A1L168 122 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 C7orf71A4D174 169 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR51F1A6NGY5 319 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 J3QR89 54 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CORTO00230 105 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB3O43676 98 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2BKO60814 126 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TCRAP04437 139 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H2BJP06899 126 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 GPX1P07203 203 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYGSP22914 178 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL22P35268 128 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HBBP68871 147 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HES1Q14469 280 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B12Q53GQ0 312 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM27BQ5VT28 67 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 C7orf65Q6ZTY9 151 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35E3Q7Z769 313 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4S1Q8NGB4 309 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NAT14Q8WUY8 206 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP3R2Q96LZ3 170 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PRO2289Q9P1D8 64 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 A2ML1A8K2U0 1454 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP14Q460N5 1801 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GVG6 124 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF727A8MUV8 499 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC179H3BU77 68 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NCR2O95944 276 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SHBGP04278 402 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 APODP05090 189 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFA4P12838 97 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-EP13747 358 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 FGF7P21781 194 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 AQP4P55087 323 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA6P56556 154 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP3R1P63098 170 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF90Q03938 601 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 RELAQ04206 551 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 LCN15Q6UWW0 184 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PATE2Q6UY27 113 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 MORN4Q8NDC4 146 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5A2Q8NGI9 324 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SDF2Q99470 211 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SCN3BQ9NY72 215 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFP30Q9Y2G7 519 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS12O14924 1447 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SMARCA4P51532 1647 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 DOCK1Q14185 1865 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 TCHHQ07283 1943 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 EML5Q05BV3 1969 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 GLI3P10071 1580 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV27A0A087WT01 109 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CCL25O15444 150 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 MT-ND6P03923 174 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 DYNLT1P63172 113 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 QRFPP83859 136 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 PLGLB1Q02325 96 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NNATQ16517 81 aa1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms