RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 OTORQ9NRC9 128 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087X0K7 114 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF253O75346 499 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFB4O95168 129 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 PAFAH1B2P68402 229 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM7Q9BQ49 75 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 Q9H3A6 140 aa22.17■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 MGAM2Q2M2H8 2515 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC3Q8IUB2 231 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf77Q96MU5 243 aa22.16■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 MEOX2P50222 304 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2BAQ96A08 127 aa22.15■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf17Q8NAS9 161 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 CLRN3Q8NCR9 226 aa22.14■■□□□ 1.14
ECHS1-201ENST00000368547 PGPA6NDG6 321 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 PSG9Q00887 426 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD4CQ8TF44 421 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 DCANP1Q8TF63 244 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 TVP23CQ96ET8 276 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 NAT8Q9UHE5 227 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 KRTAP10-11P60412 298 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa22.13■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SORL1Q92673 2214 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 OR4C46A6NHA9 309 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 H3BTX0 84 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM241Q24JQ0 296 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF674Q2M3X9 581 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SDF2L1Q9HCN8 221 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 EPDR1Q9UM22 224 aa22.12■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 K7EQG2 157 aa22.11■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV2A0A0B4J234 112 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 BEAN1Q3B7T3 259 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa22.1■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 PEX7O00628 323 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 DERL1Q9BUN8 251 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 C9JCJ5 164 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SLC17A3O00476 420 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 RHEBQ15382 184 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ATRAIDQ6UW56 229 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 FAM24BQ8N5W8 94 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 AAMDCQ9H7C9 122 aa22.09■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SOCS3O14543 225 aa22.08■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 RPL35P42766 123 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 SLC50A1Q9BRV3 221 aa22.08■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 ATG101Q9BSB4 218 aa22.08■■□□□ 1.13
ECHS1-201ENST00000368547 B4DEV8 164 aa22.07■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 M0R036 132 aa22.07■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf92Q96LL3 132 aa22.07■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 LY96Q9Y6Y9 160 aa22.07■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R60P59551 318 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 CMTM2Q8TAZ6 248 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 S100A9P06702 114 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 AKR1C3P42330 323 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 CNN1P51911 297 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 PRR25Q96S07 402 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 KLF12Q9Y4X4 402 aa22.06■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 TCRAP04437 139 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 CD7P09564 240 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF688P0C7X2 276 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD13Q5VXD3 122 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 IGFL4Q6B9Z1 124 aa22.05■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 NOTCH1P46531 2555 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 ISLRO14498 428 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 GTSCR1Q86UQ5 136 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC5AQ9NY25 188 aa22.04■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 ID1P41134 155 aa22.03■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 C7orf77A4D0Y5 90 aa22.02■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 RPL23P62829 140 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 GNG5P63218 68 aa22.02■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 PRELID1Q9Y255 219 aa22.02■■□□□ 1.12
ECHS1-201ENST00000368547 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 SCO1O75880 301 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM183BQ1AE95 376 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 ODF3L2Q3SX64 289 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01551Q86U37 167 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 RNF182Q8N6D2 247 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 MAP6D1Q9H9H5 199 aa22.02■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 FMC1Q96HJ9 113 aa22.01■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WWC5 75 aa22■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DMBP28068 263 aa22■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 CSN1S1P47710 185 aa22■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 GNG4P50150 75 aa22■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 PSMG4Q5JS54 123 aa22■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa22■■□□□ 1.11
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