RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 C22orf46C9J442 243 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 LINC01559Q495D7 138 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 MED13Q9UHV7 2174 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GUS0 222 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 SYNJ2BPP57105 145 aa16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 PRR20CP86479 221 aa16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 PRR20BP86481 221 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 PRR20AP86496 221 aa16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF815PA8K554 130 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.54■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.53■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 H3BRN7 92 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 IGHV2-70P01814 119 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 FAM231BA6NCW3 169 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 NDUFS7O75251 213 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 DNAL4O96015 105 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 TYMSP04818 313 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TMEM213A2RRL7 107 aa16.52■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.52■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.52■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 C11orf52Q96A22 123 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TMEM158Q8WZ71 300 aa16.51■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.51■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 FXYD5Q96DB9 178 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.5■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 ZNF415Q09FC8 603 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 GUSBP1Q15486 140 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 VCYO14598 125 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 CSTL1Q9H114 145 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 PCDH15Q96QU1 1955 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 WISP2O76076 250 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 SEC11AP67812 179 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 A0A087WWL8 130 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 PRR25Q96S07 402 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF6BO95407 300 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-201ENST00000345716 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.47■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 FAM208BQ5VWN6 2430 aa16.46■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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NISCH-201ENST00000345716 IGHV2-5P01817 119 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 CFAP161Q6P656 301 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 SLAQ13239 276 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 TMEM131Q92545 1883 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-201ENST00000345716 SPOCK3Q9BQ16 436 aa16.44■□□□□ 0.22
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