RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 A4D1N5 150 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TOMM40O96008 361 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5G2Q06055 141 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 STPG4Q8N801 248 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SLC17A3O00476 420 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 GP9P14770 177 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 RHEBQ15382 184 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 Q6YL49 198 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF738Q8NE65 137 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SPXQ9BT56 116 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.5□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PGPA6NDG6 321 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM250H0YL14 139 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 EDN2P20800 178 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ID1P41134 155 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 OCC1Q8TAD7 63 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.49□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PDE6DO43924 150 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 IGF1P05019 195 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PMS2P11Q13670 270 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 NAT8Q9UHE5 227 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 M0R3E3 92 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 HLA-DMBP28068 263 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 VAMP3Q15836 100 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 DPF1Q92782 380 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.48□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 K7EN84 100 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ERASQ7Z444 233 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 F8P00451 2351 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 HELTA6NFD8 242 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ISLRO14498 428 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 PLP1P60201 277 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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GGPS1-201ENST00000282841 CENPWQ5EE01 88 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SFRP2Q96HF1 295 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 Q9H3A6 140 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 H3BRN7 92 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ESM1Q9NQ30 184 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 COX11Q9Y6N1 276 aa8.47□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.46□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 SAP30O75446 220 aa8.46□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 ARL3P36405 182 aa8.46□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 FOXC2Q99958 501 aa8.46□□□□□ -1.05
GGPS1-201ENST00000282841 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 ELOBQ15370 118 aa8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 DUX3Q96PT4 197 aa8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.46□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PRE2 83 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 CKS1BP61024 79 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF702PQ9H963 129 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 RABAC1Q9UI14 185 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 SRD5A1P18405 259 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB136Q30KP8 78 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 PRR31Q5SQ13 230 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.45□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 VWFP04275 2813 aa8.44□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 PEX7O00628 323 aa8.44□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GGPS1-201ENST00000282841 GNG4P50150 75 aa8.44□□□□□ -1.06
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