RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PSMB2P49721 201 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PAX8Q06710 450 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TCF15Q12870 199 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LAGE3Q14657 143 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TM4SF20Q53R12 229 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LINC01545Q5VT33 79 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 F5H697 171 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 NPFFO15130 113 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 NPSP0C0P6 89 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 GCSHP23434 173 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 Q8NA96 180 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ZNF747Q9BV97 191 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LY6LH3BQJ8 138 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C2orf70A6NJV1 201 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 PF4V1P10720 104 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 USMG5Q96IX5 58 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 HCFC1P51610 2035 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TMEM213A2RRL7 107 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LINC00310P59036 64 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 Q8N8P6 123 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C18orf15Q96N68 181 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0BQ99437 205 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 MUC21Q5SSG8 566 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 RAXQ9Y2V3 346 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 MRAP2Q96G30 205 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ODF3BA8MYP8 253 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SNAI2O43623 268 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C17orf77Q96MU5 243 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CCL19Q99731 98 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TMEM160Q9NX00 188 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 OR11H12B2RN74 326 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF6BO95407 300 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 OR11H1Q8NG94 326 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 OR11H2Q8NH07 326 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 Q8TAT8 98 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 A0A087X0K7 114 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 H3BRM9 83 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 J3KRW8 73 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H4GQ99525 98 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 MAJINQ3KP22 176 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NCR2O95944 276 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 PLNP26678 52 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 DLX1P56177 255 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 PRR31Q5SQ13 230 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 GATD1Q8NB37 220 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0E1O15342 81 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 GTF3C1Q12789 2109 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SAA4P35542 130 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 H3BUA1 57 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL4Q99706 377 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CENPFP49454 3210 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 DEFB125Q8N687 156 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 H3BUT2 72 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 ERCC8Q13216 396 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 CTSGP08311 255 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 EVI2AP22794 236 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 Q8N976 141 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-201ENST00000264345 NCOR1O75376 2440 aa6.92□□□□□ -1.3
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