RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 FAM78BQ5VT40 261 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 HRH4Q9H3N8 390 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 WFDC1Q9HC57 220 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 H3BTX0 84 aa6.74□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 GUK1Q16774 197 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 OR11H2Q8NH07 326 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 RARRES2Q99969 163 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.74□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 A0A0J9YWU9 116 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 RNF222A6NCQ9 220 aa6.73□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 H3BQ15 152 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 PSG9Q00887 426 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.73□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 MFFQ9GZY8 342 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.73□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 FUT9Q9Y231 359 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 G3V3Q6 166 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 ARPC5O15511 151 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 OR7C2O60412 319 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 ZNF253O75346 499 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 FXYD7P58549 80 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 TAS2R45P59539 299 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 RHOBP62745 196 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 PSG3Q16557 428 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 KHDC3LQ587J8 217 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 IL17DQ8TAD2 202 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-214ENST00000625905 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.72□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.72□□□□□ -1.33
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NELFE-214ENST00000625905 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR10J4P0C629 311 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 M6PRP20645 277 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RAB2AP61019 212 aa6.71□□□□□ -1.34
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NELFE-214ENST00000625905 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 BLNKQ8WV28 456 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PAXXQ9BUH6 204 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR51M1Q9H341 326 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.71□□□□□ -1.34
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NELFE-214ENST00000625905 A8MTW9 85 aa6.7□□□□□ -1.34
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NELFE-214ENST00000625905 ATP6V0CP27449 155 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 AMTNQ6UX39 209 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 Q8NAQ8 132 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.7□□□□□ -1.34
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NELFE-214ENST00000625905 FXYD5Q96DB9 178 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-214ENST00000625905 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.7□□□□□ -1.34
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