RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01549A6NIU2 74 aa7.05□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RMI2Q96E14 147 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WWC5 75 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00205P59089 165 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC1Q9HC57 220 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 SMKR1H3BMG3 65 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TNFRSF6BO95407 300 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF126Q9BV68 326 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF222A6NCQ9 220 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2E1P51965 193 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF479Q96JC4 524 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 VWC2Q2TAL6 325 aa7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PFN2P35080 140 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE6Q13070 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PMVKQ15126 192 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 LIME1Q9H400 295 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 DKK4Q9UBT3 224 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRFP10586 1907 aa7.03□□□□□ -1.28
CYFIP1-208ENST00000617928 G3V318 75 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 AMBPP02760 352 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ID3Q02535 119 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SMPXQ9UHP9 88 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 RFNGQ9Y644 331 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00473A8K010 186 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHG3P01860 377 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 HSD52Q0P140 79 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 REG4Q9BYZ8 158 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 LYPD3O95274 346 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-5P01602 117 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2BP63146 152 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 MLANAQ16655 118 aa7.02□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf82Q6UX34 121 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8NFD4 153 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SIPA1L1O43166 1804 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 NXPH4O95158 308 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 GAS1P54826 345 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTA1P02549 2419 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 CDKN1BP46527 198 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TET1Q8NFU7 2136 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 PRB1P04280 392 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.01□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-23P01705 113 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 OVOL2Q9BRP0 275 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0J9YY99 117 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf63A6NC05 138 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 J3QLI3 93 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 HGFACQ04756 655 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6P435 159 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 AGMATQ9BSE5 352 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MWP6 167 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-16P04430 117 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM256Q8N2U0 113 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 Q9HAA7 133 aa7□□□□□ -1.29
CYFIP1-208ENST00000617928 COLCA2A8K830 154 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms