RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 OR5G3P0C626 314 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 DEFB1P60022 68 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 VAMP2P63027 116 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PSG9Q00887 426 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ARL16Q0P5N6 197 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 FAM78BQ5VT40 261 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF546Q86UE3 836 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF709Q8N972 641 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C2orf50Q96LR7 162 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 DOK5Q9P104 306 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM189A5PLL7 270 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 AGPAT2O15120 278 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 IGKV3-20P01619 116 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 HLA-DMBP28068 263 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 IL15RAQ13261 267 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RNF151Q2KHN1 245 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ARL6Q9H0F7 186 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 A0A087X0K7 114 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 F6UB75 175 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 UPK1BO75841 260 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 BCAP31P51572 246 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 CAV2P51636 162 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RAB31Q13636 194 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PATE2Q6UY27 113 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 UHRF2Q96PU4 802 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ARV1Q9H2C2 271 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 AMBPP02760 352 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CXCL2P19875 107 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 S100A11P31949 105 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 FXYD7P58549 80 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 VWC2Q2TAL6 325 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 AMTNQ6UX39 209 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZTC4 211 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 ENKURQ8TC29 256 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 MGST2Q99735 147 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 RFNGQ9Y644 331 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 IGLL5B9A064 214 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 COX7A2P2O60397 106 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 PRAF2O60831 178 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CST7O76096 145 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CXCL3P19876 107 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CAMLGP49069 296 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 SULT1A1P50225 295 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 S100A10P60903 97 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 HBG1P69891 147 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 HBG2P69892 147 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 FGL1Q08830 312 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 RAB32Q13637 225 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 C12orf74Q32Q52 190 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 STX12Q86Y82 276 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF738Q8NE65 137 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 APLNQ9ULZ1 77 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 CELA1Q9UNI1 258 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 HBE1P02100 147 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 B2MP61769 119 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 PSG3Q16557 428 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 ATP6V1FQ16864 119 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 LCN15Q6UWW0 184 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZRG5 221 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms