RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	SIX6	O95475	246 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	SULT1A1	P50225	295 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	EMP1	P54849	157 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR20E	P86478	221 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR20C	P86479	221 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR20D	P86480	221 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR20B	P86481	221 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR20A	P86496	221 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	TCTA	P57738	103 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	OPCML	Q14982	345 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941		H3BTX0	84 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC17A3	O00476	420 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PSG3	Q16557	428 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	STX12	Q86Y82	276 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	HBE1	P02100	147 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	CXCL2	P19875	107 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	BAX	Q07812	192 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	INS	P01308	110 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	AMBP	P02760	352 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	FGF7	P21781	194 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	S100A11	P31949	105 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB31	Q13636	194 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF24	Q9Y225	148 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941		H0YIZ8	118 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941		H3BQ15	152 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRAF2	O60831	178 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRM2	P04554	102 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	B2M	P61769	119 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	HBG1	P69891	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	HBG2	P69892	147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q6ZRG5	221 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	NHLH2	Q02577	135 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	NMES1	Q9C002	83 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	H2BFS	P57053	126 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	RHOB	P62745	196 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PFDN5	Q99471	154 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP3-215	ENST00000596941	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941		E5RGE8	158 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941	MPDU1	O75352	247 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941	AZU1	P20160	251 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFA1	P59665	94 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFA3	P59666	94 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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