RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551		A0A0J9YX75	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	SLC17A3	O00476	420 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.07	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551		A8MTW9	85 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CXCL2	P19875	107 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	PSG3	Q16557	428 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	PYY	P10082	97 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551		Q6ZNX1	250 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	RARRES2	Q99969	163 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.05	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	NDUFB4	O95168	129 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	FXYD7	P58549	80 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	PSG9	Q00887	426 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF266	Q14584	549 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	GUK1	Q16774	197 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.04	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551		A0A0J9YWU9	116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ARPC5	O15511	151 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ZNF253	O75346	499 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
POP4-208	ENST00000588551	AGRN	O00468	2067 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	M6PR	P20645	277 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551		X6R8D5	127 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	RAB2A	P61019	212 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	RHOB	P62745	196 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	PDE6H	Q13956	83 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	HMSD	A8MTL9	139 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551		M0R3E3	92 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	OR10J4	P0C629	311 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551		Q8NAQ8	132 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10	□□□□□ -0.81
POP4-208	ENST00000588551	TAAR5	O14804	337 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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