RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A087X0K7	114 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	C7orf71	A4D174	169 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	HIGD1C	A8MV81	97 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	GNG7	O60262	68 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCRA	P04437	139 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	NBR2	O15453	112 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	MLST8	Q9BVC4	326 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CD24	P25063	80 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CEACAM3	P40198	252 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLRD1	Q13241	179 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.46	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		K7EIM0	57 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CFHR4	Q92496	578 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	LTA	P01374	205 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	HES1	Q14469	280 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	C1RL	Q9NZP8	487 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PRD5	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PRF3	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PRM7	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		M0R1W7	72 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPR183	P32249	361 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CAMP	P49913	170 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRTN3	P24158	256 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	NPB	Q8NG41	125 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	NDUFA3	O95167	84 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		P01737	135 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	AP1S3	Q96PC3	154 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		A8MWL6	223 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMPX	Q9UHP9	88 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	FOXE3	Q13461	319 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	CT83	Q5H943	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q86TA4	180 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1B0GXF2	115 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	SEC11A	P67812	179 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	C9orf118	A6NHY6	69 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		K7EP34	96 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR2J3	O76001	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	IL4	P05112	153 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNF125	Q96EQ8	232 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		S4R3C0	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BRN7	92 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	AZU1	P20160	251 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CSNK1D-222	ENST00000584377	HBB	P68871	147 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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