RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	CST7	O76096	145 aa		13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	HBE1	P02100	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	RLN2	P04090	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	DOK5	Q9P104	306 aa		13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	GALR1	P47211	349 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	MED28	Q9H204	178 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	RNF212	Q495C1	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	STX12	Q86Y82	276 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390		E5RGE8	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	SULT1A1	P50225	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	FCN2	Q15485	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	GGACT	Q9BVM4	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
P4HB-223	ENST00000576390	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390		H0YIZ8	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	CXCL3	P19876	107 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	GPR82	Q96P67	336 aa		13.39	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	RYR1	P21817	5038 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	MPC2	O95563	127 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	PET100	P0DJ07	73 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	ORM2	P19652	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	HBG1	P69891	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	HBG2	P69892	147 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.38	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390		H3BRN7	92 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	HTN3	P15516	51 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	S100A11	P31949	105 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	DAD1	P61803	113 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		13.37	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00869	P0C866	280 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	S100A7	P31151	101 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	SELENOT	P62341	195 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	NHLH2	Q02577	135 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.36	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390		M0R2Z0	102 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	AGPAT2	O15120	278 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	PRM2	P04554	102 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	PLP1	P60201	277 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	BAX	Q07812	192 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	MGST2	Q99735	147 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	LYRM9	A8MSI8	78 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	INS	P01308	110 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	TSPO	P30536	169 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	B2M	P61769	119 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		13.34	□□□□□ -0.27
P4HB-223	ENST00000576390	HYPM	O75409	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	OR5G3	P0C626	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	FGF7	P21781	194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	CAMLG	P49069	296 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	RAP2B	P61225	183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	RAB31	Q13636	194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	CLINT1	Q14677	625 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.33	□□□□□ -0.28
P4HB-223	ENST00000576390	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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