RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGGTA-216ENST00000560243 HBG1P69891 147 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTA-216ENST00000560243 HBG2P69892 147 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTA-216ENST00000560243 RAB31Q13636 194 aa8.38□□□□□ -1.07
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RABGGTA-216ENST00000560243 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.38□□□□□ -1.07
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RABGGTA-216ENST00000560243 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTA-216ENST00000560243 THAP6Q8TBB0 222 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTA-216ENST00000560243 Q6ZRG5 221 aa8.36□□□□□ -1.07
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RABGGTA-216ENST00000560243 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTA-216ENST00000560243 C11orf94C9JXX5 98 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 PTTG1O95997 202 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 INSP01308 110 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 HBE1P02100 147 aa8.32□□□□□ -1.08
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RABGGTA-216ENST00000560243 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 DKK2Q9UBU2 259 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTA-216ENST00000560243 APLNQ9ULZ1 77 aa8.32□□□□□ -1.08
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