RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 AZU1P20160 251 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ATP5G3P48201 142 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 INPP1P49441 399 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CCL18P55774 89 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 TAS2R60P59551 318 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PLP1P60201 277 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 FCN2Q15485 313 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PSG3Q16557 428 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 BAP18Q8IXM2 172 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 SMIM8Q96KF7 97 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 V9GYH0 126 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.75□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 A0A087X0K7 114 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 C9orf170A2RU37 121 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CCDC160A6NGH7 325 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 GOSR2O14653 212 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 SSSCA1O60232 199 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 DLK1P80370 383 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 FNDC10F2Z333 226 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 NDUFB6O95139 128 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 TAS2R30P59541 319 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CLINT1Q14677 625 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 C4orf46Q504U0 113 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 TEPPQ6URK8 271 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PATE2Q6UY27 113 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CCDC190Q86UF4 302 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 C16orf74Q96GX8 76 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 UHRF2Q96PU4 802 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ARL6Q9H0F7 186 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.73□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CENPXA8MT69 81 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 H7BYZ3 331 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 K7EPK0 472 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 OR4E1P0C645 316 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CXCL2P19875 107 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CDKN1BP46527 198 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ZNF575Q86XF7 245 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 C6orf223Q8N319 242 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ARV1Q9H2C2 271 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.72□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.71□□□□□ -1.49
COCH-211ENST00000557065 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C16orf90A8MZG2 172 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 AGPAT2O15120 278 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 COX7A2P2O60397 106 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TSC22D2O75157 780 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CCNKO75909 580 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SCGB1D2O95969 90 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 OR5I1Q13606 314 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 RAB31Q13636 194 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 TRIQKQ629K1 86 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LCN15Q6UWW0 184 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZNF546Q86UE3 836 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 GGACTQ9BVM4 153 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SRRQ9GZT4 340 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 Q9H8V8 135 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.71□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 L7N2F9 121 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 VAMP2P63027 116 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 BAK1Q16611 211 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 Q6ZRG5 221 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 SSX7Q7RTT5 188 aa5.7□□□□□ -1.5
COCH-211ENST00000557065 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms