RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	PFDN5	Q99471	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222		A0A0D9SG52	128 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	SPRY2	O43597	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	CXCL2	P19875	107 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	GPR82	Q96P67	336 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222		K7EQG2	157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	TFPI2	P48307	235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	RTL8C	O15255	209 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	GALR1	P47211	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222		M0R2N4	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CS-231	ENST00000552222	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SOCS3	O14543	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	DEFB4A	O15263	64 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	BCL2L11	O43521	198 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SERF2	P84101	59 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222		A0A087X0K7	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	M6PR	P20645	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MEOX2	P50222	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	RAB2A	P61019	212 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	RNF183	Q96D59	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	IGLL5	B9A064	214 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ISLR	O14498	428 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	MB	P02144	154 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SPP1	P10451	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	PSMB3	P49720	205 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	DEFB131A	P59861	70 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	RHOB	P62745	196 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222		H3BQ15	152 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	ID1	P41134	155 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	STOML3	Q8TAV4	291 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CS-231	ENST00000552222	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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