RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 SERF2P84101 59 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MORN5Q5VZ52 161 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-212ENST00000541770 ISLRO14498 428 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SOCS3O14543 225 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 CXCL2P19875 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 M6PRP20645 277 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 C4BPBP20851 252 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP6V0CP27449 155 aa6.39□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM78BQ5VT40 261 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.39□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 C17orf77Q96MU5 243 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.39□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 BCL2L11O43521 198 aa6.38□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF688P0C7X2 276 aa6.38□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 ID1P41134 155 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB131AP59861 70 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 RHOBP62745 196 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 GUK1Q16774 197 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TMUB2Q71RG4 321 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 HRH4Q9H3N8 390 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 FUT9Q9Y231 359 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 RFNGQ9Y644 331 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF253O75346 499 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SPP1P10451 314 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TAS2R45P59539 299 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 LCN15Q6UWW0 184 aa6.37□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf92Q96LL3 132 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PPV4 95 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 KHDC3LQ587J8 217 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 STOML3Q8TAV4 291 aa6.36□□□□□ -1.39
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR51M1Q9H341 326 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 RPRMQ9NS64 109 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 H3BQ15 152 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2CO00762 179 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 SEC11BP0C7V7 166 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 PYYP10082 97 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF124Q15973 351 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 STHQ8IWL8 128 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 BAP18Q8IXM2 172 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.35□□□□□ -1.39
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